Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCP1P17987 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCP1P17987 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCP1P17987 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms