Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF7P17544 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF7P17544 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF7P17544 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF7P17544 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF7P17544 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF7P17544 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF7P17544 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF7P17544 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF7P17544 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms