Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LYL1P12980 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms