Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEFHP12036 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NEFHP12036 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NEFHP12036 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEFHP12036 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEFHP12036 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEFHP12036 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEFHP12036 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEFHP12036 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEFHP12036 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEFHP12036 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEFHP12036 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEFHP12036 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEFHP12036 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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