Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ATXN8OSP0DMR3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 C2orf74-203ENST00000432605 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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ATXN8OSP0DMR3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ATXN8OSP0DMR3 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ATXN8OSP0DMR3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ATXN8OSP0DMR3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TMEM207-201ENST00000354905 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC026765.2-201ENST00000551875 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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