Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms