Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC24AO95486 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms