Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms