Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms