Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms