Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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COPS7AQ9UBW8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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COPS7AQ9UBW8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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COPS7AQ9UBW8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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