Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL11Q9NVR0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms