Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM27Q9HBJ8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM27Q9HBJ8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM27Q9HBJ8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM27Q9HBJ8 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM27Q9HBJ8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM27Q9HBJ8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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