Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CIPCQ9C0C6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CIPCQ9C0C6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CIPCQ9C0C6 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CIPCQ9C0C6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CIPCQ9C0C6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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