Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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C9orf16Q9BUW7 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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C9orf16Q9BUW7 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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