Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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UBXN4Q92575 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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UBXN4Q92575 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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