Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPBP1Q92547 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms