Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms