Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms