Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms