Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms