Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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