Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms