Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZBED5Q49AG3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms