Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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