Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms