Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms