Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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RAB35Q15286 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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RAB35Q15286 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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RAB35Q15286 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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RAB35Q15286 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB35Q15286 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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