Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms