Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SRSF5Q13243 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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