Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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KCNH2Q12809 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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KCNH2Q12809 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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KCNH2Q12809 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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KCNH2Q12809 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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