Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms