Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms