Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFFO1Q0D2I5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms