Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms