Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms