Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms