Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLTCQ00610 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLTCQ00610 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms