Protein–RNA interactions for Protein: P98182

ZNF200, Zinc finger protein 200, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF200P98182 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF200P98182 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms