Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms