Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms