Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DAP3P51398 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DAP3P51398 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DAP3P51398 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms