Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF6P49848 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms