Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms