Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK1P39086 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms