Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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