Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFNP31947 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFNP31947 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 703.7 ms