Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTGFP29279 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTGFP29279 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTGFP29279 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTGFP29279 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTGFP29279 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms