Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNA2P26232 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms