Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP100P23497 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP100P23497 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP100P23497 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP100P23497 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP100P23497 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP100P23497 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP100P23497 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP100P23497 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP100P23497 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SP100P23497 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SP100P23497 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP100P23497 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP100P23497 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SP100P23497 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP100P23497 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP100P23497 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP100P23497 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP100P23497 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms